学院设有计算机工程系（下设计算机科学与技术教研室、网络工程教研室、物联网工程教研室），软件工程系（下设软件工程教研室、数据科学与大数据技术教研室）、人工智能系（下设数字媒体技术教研室、人工智能教研室）、计算机基础教学部（含计算机基础教研室(南通)、计算机基础教研室(海安)）、综合管理办公室（下设学院办公室、学生工作办公室、实验管理办公室），海安校区管理办公室等部门。学院现有专兼职教师168人，其中专任教师144人，正高18人，副高41人，中级45人；博士23人，博士在读19人，硕士112人；高级职称占比为40.97%，硕士以上学位占比为93.75%，“双师双能”型教师占比为38.73%。现有江苏省优秀共产党员1人、江苏省“333工程”人才2人、江苏省“六大人才高峰”高层次人才1人、江苏省青蓝工程骨干教师7人、南通市“226工程”培养对象3人、南通市优秀教育工作者3人，校年度人物2人、校“紫琅之星”10人、校教学名师2人、校骨干教师培养对象27人。有47人曾经在美国、俄罗斯、德国、英国、日本、韩国、印度、香港、澳门等国家和地区学习、进修、科研。
江苏省优秀共产党员：
韩小祥（2010）
江苏省“333工程”人才：
汪亚（2013、2016）、张海飞（2019）
江苏省“六大人才高峰”高层次人才
汪亚（2018）
江苏省青蓝工程骨干教师：
张海飞（2013）、韩小祥（2016）、王 岩（2019）、卢 曦（2020）、熊芳芳（2021）
杨雨薇（2022）、朱长永（2023）
南通市“226工程”人才：
宋 伟（2017）、张海飞（2019）、朱长永（2022）
南通理工学院年度人物：
樊文娥（2017）、黄天成（2017）、顾力平（2019）
南通理工学院教学名师：
朱长永（2020）
南通理工学院“紫琅之星”：
黄天成（2014）、 樊文娥（2015）、韩小祥（2016）、张海飞（2018）、王 佳（2019）
王 岩（2020）、 宋 伟（2020）、卢 曦（2021）、卞彩峰（2021）、朱长永（2022）
许林祥（2022）、 杨雨薇（2023）、周 立（2023）、范 军（2023）
南通理工学院中青年骨干教师培养对象:
张海飞（2016）、韩小祥（2016）、宋 伟（2016）、李同英（2016）、王 岩（2017）
卢 曦（2017）、刘琴琴（2018）、朱长永（2018）、熊芳芳（2020）、芦 欣（2020）
郑晓东（2020）、王 哲（2020）、 杨雨薇（2022）、陈枢茜（2022）、吴 芳（2022）
李秀静（2022）、雷丽婷（2022）、徐欢潇（2022）、钱兰美（2022）、陈 浩（2022）
江小静（2022）、潘 良（2022）、张 琼（2022）、吕兴琴（2022）、 陈虹云（2022）
杭益柳（2022）、严竞雄（2022）