学院设有计算机工程系（下设计算机科学与技术教研室、网络工程教研室、物联网工程教研室），计算机基础教学部（含计算机基础教研室(南通)、计算机基础教研室(海安)）、综合管理办公室（下设学院办公室、学生工作办公室、实验管理办公室），海安校区管理办公室等部门。学院现有专兼职教师130余人，其中专任教师100人，正高8人，副高7人，中级32人；博士在读8人，硕士84人；硕士以上学位占比为84%，“双师双能”型教师占比为38.73%。现有江苏省优秀共产党员1人、江苏省“333工程”人才2人、江苏省“六大人才高峰”高层次人才1人、江苏省青蓝工程骨干教师5人、南通市“226工程”培养对象1人、校年度人物3人、校“紫琅之星”11人、校骨干教师培养对象14人。有47人曾经在美国、俄罗斯、德国、英国、日本、韩国、印度、香港、澳门等国家和地区学习、进修、科研。
江苏省优秀共产党员：
韩小祥（2010）
江苏省“333工程”人才：
汪亚（2013、2016）、张海飞（2019）
江苏省“六大人才高峰”高层次人才
汪亚（2018）
江苏省青蓝工程骨干教师：
张海飞（2013）、韩小祥（2016）、卢 曦（2020）、熊芳芳（2021）
杨雨薇（2022）、
南通市“226工程”人才：
张海飞（2019）
南通理工学院年度人物：
樊文娥（2017）、黄天成（2017）、顾力平（2019）
南通理工学院“紫琅之星”：
黄天成（2014）、 樊文娥（2015）、韩小祥（2016）、张海飞（2018）、王 佳（2019）
卢 曦（2021）、卞彩峰（2021）、许林祥（2022）、 杨雨薇（2023）、周 立（2023）、
范 军（2023）
南通理工学院中青年骨干教师培养对象:
张海飞（2016）、韩小祥（2016）、 卢 曦（2017）、刘琴琴（2018）、熊芳芳（2020）、
芦 欣（2020）、郑晓东（2020）、王 哲（2020）、 杨雨薇（2022）、李秀静（2022）、
陈 浩（2022）、潘 良（2022）、 陈虹云（2022）、杭益柳（2022）、